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2015年學校官網顯示，學院有4個一級學科碩士點、28個二級學科碩士點，3個碩士專業(yè)學位授權點，2009年，藥學被列為云南省博士點立項建設學科；有7個省級重點學科。
一級學科碩士點：民族學、基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、藥學
碩士專業(yè)學位授權點：臨床醫(yī)學、藥學、教育學
省級重點學科：藥理學、病原生物學、藥物化學、基礎醫(yī)學、藥學、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學、生物學

教學建設
2015年5月學校官網顯示，學校有2個國家級特色專業(yè)建設點、3個省級重點建設專業(yè)；2個省級實驗教學示范中心；5門省級精品課程。
國家級特色專業(yè)建設點：護理學、藥學 
省級重點建設專業(yè)：臨床醫(yī)學、 護理學、藥學
省級精品課程：教育學、藥理學、醫(yī)學微生物學及免疫學、內科學、人體生理學
省級實驗教學示范中心：藥學與化學實驗中心、臨床技能實訓中心