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截至2016年8月，學(xué)校有3個國家重點(diǎn)學(xué)科，3個國家重點(diǎn)（培育）學(xué)科，2個農(nóng)業(yè)部重點(diǎn)學(xué)科，2個省級重點(diǎn)學(xué)科群，10個省級一級重點(diǎn)學(xué)科，農(nóng)業(yè)科學(xué)學(xué)科進(jìn)入ESI國際學(xué)科排名前1%。有9個博士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點(diǎn)，20個碩士學(xué)位授權(quán)一級學(xué)科點(diǎn)；1個博士專業(yè)學(xué)位授權(quán)類別，7個碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)類別；10個博士后科研流動站、2個博士后科研工作站；71個本科專業(yè)。 
世界一流學(xué)科建設(shè)學(xué)科：畜牧學(xué)
ESI全球前1%學(xué)科：農(nóng)業(yè)科學(xué)、植物學(xué)與動物學(xué) 
國家重點(diǎn)學(xué)科（3個）：農(nóng)業(yè)機(jī)械化工程、基礎(chǔ)獸醫(yī)學(xué)、動物營養(yǎng)與飼料科學(xué)。
國家重點(diǎn)學(xué)科培育點(diǎn)（3個)：蔬菜學(xué)、動物遺傳育種與繁殖、臨床獸醫(yī)學(xué)。
農(nóng)業(yè)部重點(diǎn)學(xué)科（2個）：動物遺傳育種與繁殖、動物營養(yǎng)與飼料科學(xué)。
省級重點(diǎn)學(xué)科群（2個）：新型農(nóng)業(yè)裝備制造產(chǎn)業(yè)、綠色食品生產(chǎn)與加工。
省級一級重點(diǎn)學(xué)科（10個）：作物學(xué)，畜牧學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、農(nóng)林經(jīng)濟(jì)管理、食品科學(xué)與工程、農(nóng)業(yè)工程、園藝學(xué)、生物學(xué)、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、植物保護(hù)。
“211工程”三期重點(diǎn)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目（5個）：黑龍江省糧食作物豐產(chǎn)優(yōu)質(zhì)技術(shù)與應(yīng)用、東北農(nóng)區(qū)優(yōu)質(zhì)安全畜產(chǎn)工程、東北農(nóng)區(qū)奶牛健康監(jiān)控與疾病防治、糧食主產(chǎn)區(qū)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)裝備創(chuàng)新工程、乳品大豆加工理論與關(guān)鍵技術(shù)。
博士后科研流動站（8個）：畜牧學(xué)、作物學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)工程、農(nóng)林經(jīng)濟(jì)管理、食品科學(xué)與工程、園藝學(xué)，生物學(xué)。
博士后科研工作站（2個）：國家乳品工業(yè)技術(shù)研究中心、國家大豆工程技術(shù)研究中心。
博士學(xué)位一級學(xué)科授權(quán)點(diǎn)（9個）：畜牧學(xué)、作物學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)工程、農(nóng)林經(jīng)濟(jì)管理、食品科學(xué)與工程、生物學(xué)、生態(tài)學(xué)、草學(xué)。
博士學(xué)位二級學(xué)科授權(quán)點(diǎn)（48個）：作物栽培學(xué)與耕作學(xué)，作物遺傳育種，農(nóng)業(yè)遙感與土地利用，作物生態(tài)學(xué)，農(nóng)業(yè)機(jī)械化工程，農(nóng)業(yè)水土工程，農(nóng)業(yè)生物環(huán)境與能源工程，農(nóng)業(yè)電氣化與自動化，環(huán)境水利，農(nóng)業(yè)系統(tǒng)工程與管理工程，基礎(chǔ)獸醫(yī)學(xué)，預(yù)防獸醫(yī)學(xué)，臨床獸醫(yī)學(xué)，動物藥學(xué)，動物遺傳育種與繁殖，動物營養(yǎng)與飼料科學(xué)，特種經(jīng)濟(jì)動物飼養(yǎng)，畜牧系統(tǒng)管理，動物行為學(xué)，草學(xué)，食品科學(xué)，糧食、油脂及植物蛋白工程，農(nóng)產(chǎn)品加工及貯藏工程，水產(chǎn)品加工及貯藏工程，發(fā)酵工程，植物學(xué)，微生物學(xué)，生物化學(xué)與分子生物學(xué)，動物學(xué)，發(fā)育生物學(xué)，遺傳學(xué)，生理學(xué)，水生生物學(xué)，細(xì)胞生物學(xué)，神經(jīng)生物學(xué)，生物物理學(xué)，蔬菜學(xué)，農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)管理，林業(yè)經(jīng)濟(jì)管理，生態(tài)學(xué)。
專業(yè)學(xué)位博士點(diǎn)（1個）：獸醫(yī)博士。
碩士學(xué)位一級學(xué)科授權(quán)點(diǎn)（20個）：畜牧學(xué)，作物學(xué)，獸醫(yī)學(xué)，農(nóng)業(yè)工程，農(nóng)林經(jīng)濟(jì)管理，食品科學(xué)與工程，生物學(xué)，生態(tài)學(xué)，草學(xué)，機(jī)械工程，計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)，公共管理，工商管理，管理科學(xué)與工程，植物保護(hù)，農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境，風(fēng)景園林學(xué)，軟件工程，應(yīng)用經(jīng)濟(jì)學(xué)，馬克思主義理論。
碩士學(xué)位二級學(xué)科授權(quán)點(diǎn)（101個）：作物栽培學(xué)與耕作學(xué)，作物遺傳育種，農(nóng)業(yè)遙感與土地利用，作物生態(tài)學(xué)，植物病理學(xué)，農(nóng)業(yè)昆蟲與害蟲防治，農(nóng)藥學(xué)，農(nóng)業(yè)機(jī)械化工程，農(nóng)業(yè)水土工程，農(nóng)業(yè)生物環(huán)境與能源工程，農(nóng)業(yè)電氣化與自動化，農(nóng)業(yè)系統(tǒng)工程與管理工程，環(huán)境水利，管理科學(xué)與工程，計算機(jī)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)，計算機(jī)軟件與理論，計算機(jī)應(yīng)用技術(shù)，軟件工程，機(jī)械電子工程，機(jī)械制造及其自動化，機(jī)械設(shè)計及理論，車輛工程，基礎(chǔ)獸醫(yī)學(xué)，預(yù)防獸醫(yī)學(xué)，臨床獸醫(yī)學(xué)，動物藥學(xué)，動物遺傳育種與繁殖，動物營養(yǎng)與飼料科學(xué)，特種經(jīng)濟(jì)動物飼養(yǎng)，畜牧系統(tǒng)管理，動物行為學(xué)，草學(xué)，食品科學(xué)，糧食、油脂及植物蛋白工程，農(nóng)產(chǎn)品加工及貯藏工程，水產(chǎn)品加工及貯藏工程，發(fā)酵工程，植物學(xué)，微生物學(xué)，生物化學(xué)與分子生物學(xué)，動物學(xué)，發(fā)育生物學(xué)，遺傳學(xué)，生理學(xué)，水生生物學(xué)，細(xì)胞生物學(xué)，神經(jīng)生物學(xué)，生物物理學(xué)，水文學(xué)及水資源，生物化工，應(yīng)用化學(xué)，土壤學(xué)，植物營養(yǎng)學(xué)，生態(tài)學(xué)，行政管理，社會醫(yī)學(xué)與衛(wèi)生管理，教育經(jīng)濟(jì)與管理，社會保障，土地資源管理，果樹學(xué)，蔬菜學(xué)，風(fēng)景園林學(xué)，國民經(jīng)濟(jì)學(xué)，區(qū)域經(jīng)濟(jì)學(xué)，財政學(xué)（含：稅收學(xué)），金融學(xué)（含：保險學(xué)），產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟(jì)學(xué)，國際貿(mào)易學(xué)，勞動經(jīng)濟(jì)學(xué)，統(tǒng)計學(xué)，數(shù)量經(jīng)濟(jì)學(xué)，國防經(jīng)濟(jì)學(xué)，會計學(xué)，旅游管理，技術(shù)經(jīng)濟(jì)及管理，農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)管理，林業(yè)經(jīng)濟(jì)管理，馬克思主義基本原理，馬克思主義發(fā)展史，馬克思主義中國化研究，國外馬克思主義研究，思想政治教育，英語語言文學(xué)，企業(yè)管理（含財務(wù)管理、市場營銷、人力資源管理）。
專業(yè)學(xué)位碩士點(diǎn)（5個）：工程碩士，農(nóng)業(yè)推廣碩士，獸醫(yī)碩士，公共管理，工商管理。
本科專業(yè)（75個）：生物科學(xué)，生物技術(shù)，資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理，環(huán)境科學(xué)，機(jī)械設(shè)計制造及其自動化，子信息工程，計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)，水利水電工程，食品科學(xué)與工程，生物工程，農(nóng)業(yè)機(jī)械化其自動化，農(nóng)業(yè)電氣化與自動化，農(nóng)業(yè)建筑環(huán)境與能源工程，農(nóng)業(yè)水利工程，農(nóng)學(xué)，園藝，植物保護(hù)，園林，農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境，動物科學(xué)，動物醫(yī)學(xué)，水產(chǎn)養(yǎng)殖學(xué)，信息管理與信息系統(tǒng)，工業(yè)工程，工程管理，工商管理，市場營銷，會計學(xué)，，行政管理，土地資源管理，農(nóng)林經(jīng)濟(jì)管理，金融學(xué)，法學(xué)，英語，應(yīng)用化學(xué)，農(nóng)村區(qū)域發(fā)展，人力資源管理，信息與計算科學(xué)，國際經(jīng)濟(jì)與貿(mào)易，生態(tài)學(xué)，，保險學(xué)，社會工作，動物藥學(xué)，食品質(zhì)量與安全，土木工程，旅游管理，糧食工程，電氣工程及其自動化，音樂表演，藝術(shù)設(shè)計，草業(yè)科學(xué)，俄語，風(fēng)景園林，乳品工程，制藥工程，水文與水資源工程，應(yīng)用生物科學(xué)，軟件工程，物流工程，統(tǒng)計學(xué)，種子科學(xué)與工程，車輛工程，農(nóng)藝教育，園藝教育，畜禽生產(chǎn)教育，植物保護(hù)教育，廣播電視編導(dǎo)，對外漢語，包裝工程，物聯(lián)網(wǎng)工程，環(huán)境工程，植物科學(xué)與技術(shù)。
教學(xué)建設(shè)
質(zhì)量工程
截至2016年8月，擁有國家級特色專業(yè)10個，國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)區(qū)2個，國家級精品課程4門、國家級精品視頻公開課4門、國家級精品資源共享課2門，國家級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心3個，國家級大學(xué)生校外實(shí)踐教育基地4個，教育部、農(nóng)業(yè)部農(nóng)科教合作人才培養(yǎng)基地4個，科技部創(chuàng)新人才培養(yǎng)基地1個，全國高校學(xué)生科技創(chuàng)業(yè)實(shí)習(xí)基地1個；獲得全國“百篇”優(yōu)秀博士學(xué)位論文1篇、提名4篇。學(xué)校是國家現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育試點(diǎn)院校，設(shè)有全國重點(diǎn)建設(shè)職業(yè)教育師資培養(yǎng)培訓(xùn)基地。
國家級特色專業(yè)：動物醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)機(jī)械化及其自動化、農(nóng)學(xué)、生物技術(shù)、農(nóng)業(yè)水利工程、園藝、動物科學(xué)、計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)、食品科學(xué)與工程、農(nóng)林經(jīng)濟(jì)管理。
國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)區(qū)：乳品工程“3+1”人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)區(qū)、動物科學(xué)專業(yè)創(chuàng)業(yè)人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)區(qū)。
國家級精品課程：獸醫(yī)外科學(xué)、動物生物化學(xué)。
國家級精品視頻公開課：乳與健康。
國家級精品資源共享課：動物生物化學(xué)、獸醫(yī)外科學(xué)。
國家級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心：食品科學(xué)與工程實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心、植物科學(xué)與技術(shù)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心、生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心
國家級大學(xué)生校外實(shí)踐教育基地：東北農(nóng)業(yè)大學(xué)-潤盈生物工程（上海）有限公司工程實(shí)踐教育中心、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)-黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院綏化分院農(nóng)科教合作人才培養(yǎng)基地、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)-黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝分院農(nóng)科教合作人才培養(yǎng)基地、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)-蘭西縣種豬場農(nóng)科教合作人才培養(yǎng)基地。 
教育部、農(nóng)業(yè)部農(nóng)科教合作人才培養(yǎng)基地：東北農(nóng)業(yè)大學(xué)綏化大豆農(nóng)科教合作人才培養(yǎng)基地、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)哈爾濱大宗蔬菜農(nóng)科教合作人才培養(yǎng)基地、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)蘭西生豬農(nóng)科教合作人才培養(yǎng)基地、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)哈爾濱西甜瓜農(nóng)科教合作人才培養(yǎng)基地。